Doris存储文件格式优化

文件格式

图1. doris segment文件格式

文件包括：

文件开始是8个字节的magic code，用于识别文件格式和版本
Data Region：用于存储各个列的数据信息，这里的数据是按需分page加载的
Index Region: doris中将各个列的index数据统一存储在Index Region，这里的数据会按照列粒度进行加载，所以跟列的数据信息分开存储
Footer信息
- FileFooterPB:定义文件的元数据信息
- 4个字节的footer pb内容的checksum
- 4个字节的FileFooterPB消息长度，用于读取FileFooterPB
- 8个字节的MAGIC CODE，之所以在末位存储，是方便不同的场景进行文件类型的识别

文件中的数据按照page的方式进行组织，page是编码和压缩的基本单位。现在的page类型包括以下几种:

DataPage

DataPage分为两种：nullable和non-nullable的data page。

nullable的data page内容包括：

                 +----------------+
                 |  value count   |
                 |----------------|
                 |  first row id  |
                 |----------------|
                 | bitmap length  |
                 |----------------|
                 |  null bitmap   |
                 |----------------|
                 |     data       |
                 |----------------|
                 |    checksum    |
                 +----------------+

non-nullable data page结构如下：

                 |----------------|
                 |   value count  |
                 |----------------|
                 |  first row id  |
                 |----------------|
                 |     data       |
                 |----------------|
                 |    checksum    |
                 +----------------+

其中各个字段含义如下：

value count
- 表示page中的行数
first row id
- page中第一行的行号
bitmap length
- 表示接下来bitmap的字节数
null bitmap
- 表示null信息的bitmap
data
- 存储经过encoding和compress之后的数据
- 需要在数据的头部信息中写入：is_compressed
- 各种不同编码的data需要在头部信息写入一些字段信息，以实现数据的解析
  - TODO：添加各种encoding的header信息
checksum
- 存储page粒度的校验和，包括page的header和之后的实际数据

Bloom Filter Pages

针对每个bloom filter列,会在page的粒度相应的生成一个bloom filter的page，保存在bloom filter pages区域

Ordinal Index Page

针对每个列，都会按照page粒度，建立行号的稀疏索引。内容为这个page的起始行的行号到这个block的指针（包括offset和length）

Short Key Index page

我们会每隔N行（可配置）生成一个short key的稀疏索引，索引的内容为：short key->行号(ordinal)

Column的其他索引

该格式设计支持后续扩展其他的索引信息，比如bitmap索引，spatial索引等等，只需要将需要的数据写到现有的列数据后面，并且添加对应的元数据字段到FileFooterPB中

元数据定义

SegmentFooterPB的定义为：

message ColumnPB {
    required int32 unique_id = 1;   // 这里使用column id, 不使用column name是因为计划支持修改列名
    optional string name = 2;   // 列的名字,  当name为__DORIS_DELETE_SIGN__, 表示该列为隐藏的删除列
    required string type = 3;   // 列类型
    optional bool is_key = 4;   // 是否是主键列
    optional string aggregation = 5;    // 聚合方式
    optional bool is_nullable = 6;      // 是否有null
    optional bytes default_value = 7;   // 默认值
    optional int32 precision = 8;       // 精度
    optional int32 frac = 9;
    optional int32 length = 10;         // 长度
    optional int32 index_length = 11;   // 索引长度
    optional bool is_bf_column = 12;    // 是否有bf词典
    optional bool has_bitmap_index = 15 [default=false];  // 是否有bitmap索引
}

// page偏移
message PagePointerPB {
    required uint64 offset; // page在文件中的偏移
    required uint32 length; // page的大小
}

message MetadataPairPB {
  optional string key = 1;
  optional bytes value = 2;
}

message ColumnMetaPB {
    optional ColumnMessage encoding; // 编码方式

    optional PagePointerPB dict_page // 词典page
    repeated PagePointerPB bloom_filter_pages; // bloom filter词典信息
    optional PagePointerPB ordinal_index_page; // 行号索引数据
    optional PagePointerPB page_zone_map_page; // page级别统计信息索引数据

    optional PagePointerPB bitmap_index_page; // bitmap索引数据

    optional uint64 data_footprint; // 列中索引的大小
    optional uint64 index_footprint; // 列中数据的大小
    optional uint64 raw_data_footprint; // 原始列数据大小

    optional CompressKind compress_kind; // 列的压缩方式

    optional ZoneMapPB column_zone_map; //文件级别的过滤条件
    repeated MetadataPairPB column_meta_datas;
}

message SegmentFooterPB {
    optional uint32 version = 2 [default = 1]; // 用于版本兼容和升级使用
    repeated ColumnPB schema = 5; // 列Schema
  optional uint64 num_values = 4; // 文件中保存的行数
  optional uint64 index_footprint = 7; // 索引大小
  optional uint64 data_footprint = 8; // 数据大小
    optional uint64 raw_data_footprint = 8; // 原始数据大小

  optional CompressKind compress_kind = 9 [default = COMPRESS_LZO]; // 压缩方式
  repeated ColumnMetaPB column_metas = 10; // 列元数据
    optional PagePointerPB key_index_page; // short key索引page
}

读写逻辑

写入

大体的写入流程如下：

写入magic
根据schema信息，生成对应的ColumnWriter，每个ColumnWriter按照不同的类型，获取对应的encoding信息（可配置），根据encoding，生成对应的encoder
调用encoder->add(value)进行数据写入，每隔K行，生成一个short key index entry，并且，如果当前的page满足一定条件（大小超过1M或者行数为K），就生成一个新的page，缓存在内存中。
不断的循环步骤3，直到数据写入完成。将各个列的数据依序刷入文件中
生成FileFooterPB信息，写入文件中。

读取

读取文件的magic，判断文件类型和版本
读取FileFooterPB，进行checksum校验
按照需要的列，读取short key索引和对应列的数据ordinal索引信息
使用start key和end key，通过short key索引定位到要读取的行号，然后通过ordinal索引确定需要读取的row ranges, 同时需要通过统计信息、bitmap索引等过滤需要读取的row ranges
然后按照row ranges通过ordinal索引读取行的数据

编码

现有的doris存储中，针对string类型的编码，采用plain encoding的方式，效率比较低。经过对比，发现在百度统计的场景下，数据会因为string类型的编码膨胀超过一倍。所以，计划引入基于词典的编码压缩。

压缩

实现可扩展的压缩框架，支持多种压缩算法，方便后续添加新的压缩算法，计划引入zstd压缩。

TODO

如何实现嵌套类型？如何在嵌套类型中进行行号定位？
如何优化现在的ScanRange拆分导致的下游bitmap、column statistic统计等进行多次？

Doris存储文件格式优化

文件格式​

DataPage​

Bloom Filter Pages​

Ordinal Index Page​

Short Key Index page​

Column的其他索引​

元数据定义​

读写逻辑​

写入​

读取​

编码​

压缩​

TODO​